MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 7694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012943	ATC	2	6	331603	331608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_012943	AGT	2	6	333323	333328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012943	GGT	2	6	333346	333351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_012943	ATG	2	6	333356	333361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_012943	G	6	6	336283	336288	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
506	NC_012943	GGTA	2	8	336302	336309	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_012943	GCCG	2	8	336389	336396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
508	NC_012943	TGGC	2	8	336401	336408	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
509	NC_012943	CGG	2	6	336409	336414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_012943	AAG	2	6	339250	339255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_012943	ACA	2	6	339272	339277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_012943	G	6	6	339281	339286	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
513	NC_012943	GT	3	6	339333	339338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_012943	GCCG	2	8	339378	339385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_012943	TGGC	2	8	339390	339397	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
516	NC_012943	CGG	2	6	342006	342011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_012943	GCA	2	6	342105	342110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_012943	GCG	2	6	342161	342166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_012943	GTG	2	6	342171	342176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_012943	TCA	2	6	342203	342208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_012943	GTG	2	6	342216	342221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012943	GGTCGC	2	12	344928	344939	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_012943	GA	3	6	354382	354387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_012943	CTG	2	6	354693	354698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_012943	GAT	2	6	364107	364112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_012943	GCG	2	6	366070	366075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_012943	TAG	2	6	366093	366098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_012943	ATC	2	6	366672	366677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_012943	G	7	7	367356	367362	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
530	NC_012943	CTGT	2	8	367374	367381	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
531	NC_012943	AATC	2	8	378644	378651	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
532	NC_012943	CTA	2	6	378654	378659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_012943	TCG	2	6	378770	378775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_012943	CTTGA	2	10	380776	380785	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
535	NC_012943	CGT	2	6	381520	381525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_012943	ACC	2	6	383333	383338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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538	NC_012943	GTA	2	6	385344	385349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_012943	GAG	2	6	385365	385370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_012943	CGG	2	6	386448	386453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_012943	CAC	2	6	386454	386459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_012943	TCG	2	6	386508	386513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_012943	TCA	2	6	388850	388855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_012943	GCC	2	6	388877	388882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_012943	GCA	2	6	388902	388907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_012943	TCGCA	2	10	388946	388955	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
547	NC_012943	CGA	2	6	388989	388994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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549	NC_012943	GCC	2	6	389036	389041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_012943	AAGG	2	8	390020	390027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_012943	CGG	2	6	390714	390719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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553	NC_012943	TTC	2	6	390742	390747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_012943	GCG	2	6	391445	391450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_012943	TCG	2	6	391461	391466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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557	NC_012943	GGA	2	6	394151	394156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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559	NC_012943	GCC	2	6	394177	394182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_012943	GGC	2	6	396932	396937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_012943	GAC	2	6	398210	398215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_012943	ATA	2	6	398980	398985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012943	TGAC	2	8	398989	398996	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_012943	GTCA	2	8	399000	399007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
565	NC_012943	GCG	2	6	399030	399035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_012943	AT	3	6	399054	399059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_012943	CGG	2	6	402414	402419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_012943	CGG	2	6	402956	402961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_012943	GTA	2	6	403040	403045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_012943	TTG	2	6	404623	404628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_012943	GTT	2	6	404636	404641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_012943	GCG	2	6	404677	404682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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577	NC_012943	AGG	2	6	411508	411513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_012943	CGG	2	6	412107	412112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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581	NC_012943	TGG	2	6	417163	417168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_012943	CAACG	2	10	417172	417181	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
583	NC_012943	CG	3	6	417868	417873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
584	NC_012943	GCG	2	6	418349	418354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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587	NC_012943	CG	3	6	419882	419887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_012943	ATCG	2	8	419970	419977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
589	NC_012943	TGT	2	6	419991	419996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_012943	GCCA	2	8	420061	420068	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
591	NC_012943	GTCC	2	8	420087	420094	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
592	NC_012943	ACGG	2	8	420173	420180	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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599	NC_012943	GC	3	6	426961	426966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
600	NC_012943	GAGC	2	8	427006	427013	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
601	NC_012943	GC	3	6	427012	427017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
602	NC_012943	GAGC	2	8	427057	427064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
603	NC_012943	GC	3	6	427063	427068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
604	NC_012943	ACC	3	9	437568	437576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_012943	GTG	2	6	437579	437584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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607	NC_012943	CCTAC	2	10	439690	439699	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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610	NC_012943	CGA	2	6	441610	441615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_012943	CAG	2	6	441674	441679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_012943	GGC	2	6	442666	442671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_012943	CGG	2	6	442687	442692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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615	NC_012943	GAC	2	6	445177	445182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_012943	TC	3	6	448101	448106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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620	NC_012943	GAT	2	6	456201	456206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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623	NC_012943	GCG	2	6	458677	458682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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627	NC_012943	GTC	2	6	468309	468314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_012943	GTCCG	2	10	468347	468356	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
629	NC_012943	TCG	2	6	468365	468370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_012943	GGC	2	6	468411	468416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_012943	GGAT	2	8	468432	468439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_012943	TCA	2	6	468450	468455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_012943	CCT	2	6	468498	468503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_012943	AAT	2	6	468553	468558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_012943	CGAG	2	8	468575	468582	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
636	NC_012943	TCC	2	6	472901	472906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_012943	GCC	2	6	473015	473020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_012943	TCGGA	2	10	473022	473031	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
639	NC_012943	GGT	2	6	475162	475167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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759	NC_012943	GGA	2	6	565973	565978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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761	NC_012943	GGC	2	6	568173	568178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
762	NC_012943	GC	3	6	570066	570071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
763	NC_012943	CGA	2	6	570086	570091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
764	NC_012943	GC	3	6	570092	570097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
765	NC_012943	GC	4	8	570105	570112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
766	NC_012943	CGA	2	6	570142	570147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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768	NC_012943	GC	4	8	570161	570168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
769	NC_012943	CGG	2	6	571863	571868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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771	NC_012943	GC	3	6	571878	571883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
772	NC_012943	TAA	2	6	574016	574021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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